Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms