Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms