Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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