Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms