Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms