Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms