Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Sh3bp1P55194 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Sh3bp1P55194 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Sh3bp1P55194 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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