Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms