Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18526 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
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P18526 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18526 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18526 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18526 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18526 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18526 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18526 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18526 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18526 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18526 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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