Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DmdP11531 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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DmdP11531 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms