Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
EdaO54693 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
EdaO54693 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
EdaO54693 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
EdaO54693 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
EdaO54693 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
EdaO54693 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
EdaO54693 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
EdaO54693 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
EdaO54693 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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