Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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