Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hps1O08983 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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