Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm2888K7N746 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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