Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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