Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Usp36B1AQJ2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp36B1AQJ2 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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