Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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