Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Col5a3Q9JLI2 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Col5a3Q9JLI2 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Col5a3Q9JLI2 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Col5a3Q9JLI2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Col5a3Q9JLI2 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Col5a3Q9JLI2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Col5a3Q9JLI2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Col5a3Q9JLI2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Col5a3Q9JLI2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Col5a3Q9JLI2 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Col5a3Q9JLI2 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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