Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms