Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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