Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed11Q9D2R4 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed11Q9D2R4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed11Q9D2R4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed11Q9D2R4 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed11Q9D2R4 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed11Q9D2R4 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed11Q9D2R4 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed11Q9D2R4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed11Q9D2R4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed11Q9D2R4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed11Q9D2R4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed11Q9D2R4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed11Q9D2R4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed11Q9D2R4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed11Q9D2R4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms