Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Zbed3Q9D0L1 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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