Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Exo5Q9CXP9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Exo5Q9CXP9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Exo5Q9CXP9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Exo5Q9CXP9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Exo5Q9CXP9 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Exo5Q9CXP9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Exo5Q9CXP9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Exo5Q9CXP9 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Exo5Q9CXP9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Exo5Q9CXP9 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Exo5Q9CXP9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Exo5Q9CXP9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Exo5Q9CXP9 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Exo5Q9CXP9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms