Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim8Q9CQQ0 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms