Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms