Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Cldn34c1Q8K193 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Cldn34c1Q8K193 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn34c1Q8K193 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn34c1Q8K193 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn34c1Q8K193 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Cldn34c1Q8K193 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c1Q8K193 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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