Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc28aQ8CEI3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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