Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Mro-206ENSMUST00000179472 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm30655-201ENSMUST00000220498 1383 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms