Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AknaQ80VW7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AknaQ80VW7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms