Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms