Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ly6eQ64253 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ly6eQ64253 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms