Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Ccdc18Q640L5 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Ccdc18Q640L5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Ccdc18Q640L5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ccdc18Q640L5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ccdc18Q640L5 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ccdc18Q640L5 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ccdc18Q640L5 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ccdc18Q640L5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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