Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tnfsf15Q5UBV8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms