Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Dab2-202ENSMUST00000080880 4663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Srek1ip1Q4V9W2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Srek1ip1Q4V9W2 Pde2a-212ENSMUST00000211368 3885 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Nrp2-201ENSMUST00000027112 4216 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Srek1ip1Q4V9W2 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Srek1ip1Q4V9W2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Srek1ip1Q4V9W2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Srek1ip1Q4V9W2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Srek1ip1Q4V9W2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Srek1ip1Q4V9W2 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srek1ip1Q4V9W2 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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