Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc27a5Q4LDG0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms