Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gtpbp2Q3UJK4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gtpbp2Q3UJK4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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