Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ssbp4Q3U4B1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ssbp4Q3U4B1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ssbp4Q3U4B1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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