Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZW0

Ecscr, Endothelial cell-specific chemotaxis regulator, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EcscrQ3TZW0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
EcscrQ3TZW0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
EcscrQ3TZW0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
EcscrQ3TZW0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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EcscrQ3TZW0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
EcscrQ3TZW0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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EcscrQ3TZW0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
EcscrQ3TZW0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
EcscrQ3TZW0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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EcscrQ3TZW0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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EcscrQ3TZW0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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EcscrQ3TZW0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
EcscrQ3TZW0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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EcscrQ3TZW0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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EcscrQ3TZW0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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