Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms