Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RptnP97347 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RptnP97347 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RptnP97347 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RptnP97347 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RptnP97347 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RptnP97347 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RptnP97347 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RptnP97347 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RptnP97347 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RptnP97347 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms