Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Mro-202ENSMUST00000120033 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Olfr450-202ENSMUST00000218832 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Pcdhb6-201ENSMUST00000061717 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Siglech-201ENSMUST00000060416 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Wdr93-201ENSMUST00000035622 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Nt5c1b-217ENSMUST00000219826 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Zfp536-206ENSMUST00000176205 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Fkbp5-206ENSMUST00000177939 3844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Pwp1-201ENSMUST00000001836 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Krt78-201ENSMUST00000164932 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm9866-205ENSMUST00000220998 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sem1P60897 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms