Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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