Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RorcP51450 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RorcP51450 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RorcP51450 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RorcP51450 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RorcP51450 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RorcP51450 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RorcP51450 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms