Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms