Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hcls1P49710 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms