Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprkP35822 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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