Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa10P31310 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms