Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gjb1P28230 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gjb1P28230 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb1P28230 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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