Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms