Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms